Ale nie chodzi tylko o mistycyzm miejsca, w którym znajduje się Petersburg. Sama natura ma tutaj mroczną aurę. Naukowcy uważają, że Północna Stolica znajduje się na styku czterech płyt tektonicznych: tarczy bałtyckiej i płyty rosyjskiej z jednej strony oraz dwóch płyt na rozległym uskoku północno-zachodnim z drugiej.
Miejsca powyżej uskoków w skorupie ziemskiej są geopatogenne. Uskoki geologiczne w skorupie ziemskiej powodują silne zmiany pola elektromagnetycznego na powierzchni. Ponadto w takich miejscach na powierzchnię może wypływać radon, bezbarwny i bezwonny, radioaktywny gaz jednoatomowy. Znajdujący się w organizmie człowieka radon wyzwala w nim patologiczne procesy prowadzące do raka płuc - jest uważany za drugi najczęstszy (po paleniu) czynnik wywołujący tę chorobę.
Uważa się, że życie w strefach geopatogennych negatywnie wpływa na zdrowie fizyczne i psychiczne człowieka. Ludzie mieszkający w takich strefach są bardziej narażeni na choroby, wypadki, wypadki samochodowe, katastrofy spowodowane przez człowieka itp. W Petersburgu od 20 do 40 procent populacji miasta żyje w strefach geopatogennych. Okręg Krasnoselski, Wyspa Wasiljewska, Ozerki, Grażdanka, Kupchino i obszary wzdłuż rzeki Newy są uważane za strefy geopatogenne.
W 1995 roku naukowcy E. K. Melnikov i V. A. Rudnik przeprowadzili badanie statystyki medycznej w rejonie Grazhdansky Prospekt. Po zbadaniu kart ambulatoryjnych w poliklinikach stwierdzili, że w niektórych domach oczekiwana długość życia była znacznie niższa od średniej, a zapadalność wyższa. Zanotowano wzrost zachorowalności na chorobę niedokrwienną serca i wzrost liczby chorych na raka (St. Petersburg jest generalnie jednym z liderów w Rosji pod względem liczby chorych na raka na tysiąc mieszkańców). Naukowcy doszli do wniosku, że domy te znajdują się tuż przy uskokach skorupy ziemskiej.
Ale według naukowców strefy geopatogenne nie tylko powodują choroby, ale także stymulują twórczą aktywność człowieka i najwyraźniej z tego powodu Petersburg jest uważany za kulturową stolicę Rosji, a twórcza aktywność ludności tutaj zawsze była bardzo wysoka.