Na początku XVIII wieku Biblioteka Królewska w Madrycie otrzymała rękopis zatytułowany „Historia cesarzy bizantyjskich w Konstantynopolu od 811 do 1057, napisany przez Kurapalata Jana Skilicy”. Jego datowanie budzi kontrowersje wśród bizantyjskich paleografów. Jedni przypisują to połowie - drugiej połowy XIII wieku, inni (np. Bułgarski badacz A. Bożkow) przełomowi XII i XIII wieku.
W późnych latach siedemdziesiątych N. Wilson datował rękopis na połowę XII wieku na podstawie identyfikacji pisma ręcznego i wykazał jego południowowłoskie pochodzenie. W tym przypadku najprawdopodobniej madrycka kopia Historii została wykonana w skryptorium pałacowym w Palermo na podstawie kopii oryginału podarowanego cesarzowi przez samego Skylitzię, wykonanej w 1158 r. Dla Henryka Arystypusa, ambasadora Królestwa Sycylii, najwybitniejszego intelektualisty Palermo.
Rękopis zawiera 574 miniatury, dlatego manuskrypt madrycki jest uważany za jeden z najważniejszych pomników bizantyjskich miniatur historycznych.